最主要的防霉措施是控制原料及贮存时的温度、湿度，即原料中水分和储存环境中的温度和湿度。其方法主要有：
1、严格控制饲料原料的水分含量：
一般要求玉米、高粱、稻谷中的水分不超过14%；大豆及其饼粕、麦类、次粉、糠麸类、甘薯干、木薯干不超过13%；棉籽饼粕、菜籽饼粕、向日葵仁饼粕、亚麻仁饼粕、花生仁饼粕、鱼粉、骨粉及肉骨粉不超过12%。
2、原料贮存时的防治措施
在原料贮存中，一定要注意空气、湿度、温度等的控制，要严格按照”先进先出”的使用原则，要及时清理已被污染的原料，可使用的方法有：控制贮存环境的温度、封闭隔氧贮存、气调贮存、低温通风贮存及辐射法，例如把脱粒后的湿玉米装入内衬塑料袋的麻袋，装满并扎紧袋口可抑制黄曲霉的生长，也可以添加防霉剂（如丙酸及其盐类、山梨酸及其盐类、双乙酸钠等）。
3、饲料贮存中的防治措施
仓库要通风、阴凉、干燥、清洁，没有霉积料。其次堆入要规范，应与窗、壁保持一定的距离，贮存时间长的话还要定期翻动通风。再次是防霉剂的使用。
在饲料中添加的化学防霉剂种类很多，可分为单方和复方两大类，单方多用丙酸盐类防霉剂，如克霉灵、除霉净、霉敌101、露保细、万路保、克霉霸、露保细盐、露保细NC，具体使用方法是：密封包装的含水量12.5％～13.5％的颗粒料贮存1个月以上，应添加0.3％的丙酸钙。水分在11.55％～12.5％的粉料贮存2月以上的则加丙酸钙0.15％。南方地区由于雨水较多，3～5月间最好添加0.2％～0.4％的丙酸钙或丙酸钠。除丙酸及其盐类外，还可用山梨酸及其盐类、苯甲酸和苯甲酸钠、甲酸和甲酸钠、甲酸钙、马酸二甲酯及大蒜素等。这些防霉剂具有破坏或阻断病原微生物的作用，但又不会阻碍消化道中正常有益菌群和酶的活动，有的还能改善饲料的口味和提高饲料的适口性品质。为了提高防霉剂的防霉能力和综合品质，除了使用单方防霉剂以外，目前国际上多采用复合型的防霉剂，如万香保、克霉霸等。
复方防霉剂的广谱抗菌防霉能力更强，适用范围更宽。日本在饲料中经常使用的复方防霉剂有：
a.用92%海藻物、4%碘酸钙、4%丙酸钙组成，使用时按8%的比例添加到饲料中，这种防霉剂除了防霉效果好以外，最大特点是增加了海藻物中各种微量元素，如钙、铁、锌、碘、铜等，使饲料中的微量元素更丰富。
b.用1份醋酸钠和2份醛酸混合均匀，然后在混合物中加入1%的山梨酸，充分搅拌并干燥即可。使用时按1%比例加入到饲料中。
c.用1份碳酸钠和2份醛酸混合均匀，然后在混合物中加入1%的山梨酸，充分拌匀并干燥，使用时按1%的比例加入到饲料中。
不管使用单方或复方防霉剂，一般都不要与碱性物质混合使用，以增强防霉的效果。