鱼粉的特点是零碎、有气味和具有吸潮性，并含有较高的水分及不饱和脂肪酸，因而不易久存。由于鱼粉中含有较高的脂肪，而鱼粉的脂肪中含有较多的不饱和脂肪酸，其中的碳碳双键易于吸氧使鱼粉进行缓慢氧化，甚至会引起自燃。因此鱼粉中的水分含量很重要，如果水分低于6%，就没有足够的湿度进行保护，会促使油分的挥发，从而增加过氧化值;如果水分超过12%，那么细菌与虫害活动以及氧化反应加速，从而产生热量与可燃性磷化氢(PH3)气体，如果热量和PH3蓄积到一定程度且鱼粉与空气接触时，就会自燃，因此鱼粉的安全水分因保持在7%-10%之间(南方气候由于湿度大，上限应该在9%左右)。
(1)高温对鱼粉的影响
　　在湿法加工中，鱼粉的高温环节有蒸煮、压榨、干燥和粉碎等工艺流程。 在此四个环节中，蒸煮、压榨和干燥都是高温型作业流程，其中，蒸煮与压榨都与高温型物料接触。物料中的不饱和脂肪酸非常容易氧化;压榨除了自身物料是高温外，还因为挤压摩擦而产热。粉碎环节虽然物料已经冷却，但由于物料在粉碎机内的筛片和筛网之间高速回旋撞击，也有摩擦产热。采取的措施：如在蒸煮和干燥环节加入一定比例的双氧水以防先期氧化，同时，在鱼粉冷却后河粉碎前加入固体粉末抗氧化剂。抗氧化剂能防止过氧化基的形成，切断氧化反应链，并取得了一定的效果。

(2)鱼粉仓储及管理

　　①储存仓库要求：必须清洁、干燥、阴凉通风、易散热等，同时能防止日晒、防雨淋、防吸潮、防虫害等。

　　②仓储应备工具：测温器材、干湿温度计、垫板、防水防潮塑料布或苫布、抽样钎、 抽样盘等。
　　③鱼粉的仓储管理

　　a.鱼粉的入库堆码：ⅰ.鱼粉入库前，应对整个仓库进行消毒，包括地面、墙壁及其它死角等地方。ⅱ.入库堆放时，鱼粉在库房里靠墙的一侧，应离开干墙壁20cm(库房墙壁的厚薄应视当地的气候情况和库房地面的吸潮程度而定)。 ⅲ.地面应有垫板与地面隔开(有条件的必须铺上防水防潮塑料胶布或苫布)。 ⅳ.垛位不宜过大或过高，一般以0-60t为宜，高度不宜超过15个鱼粉包装物高。ⅴ.垛位与垛位之间应有适当的距离。要考虑在垛位与垛位之间是否需要车辆的进出。如果不需要，其间距至少不低于1m以方便人员巡视和抽样检查。
　　 b.鱼粉入库后的“身份证”的内容 每一个鱼粉垛位都必须有其自己的“身份证”—-标牌，标牌应该涵盖以下内容：ⅰ.货物来源;ⅱ.入库日期;ⅲ.件数;ⅳ.规格;ⅴ.吨位;ⅵ.货物去向;ⅶ.去向日期;ⅷ.去向吨位;ⅸ.备注等

　　c.鱼粉仓库的日常管理 保管员每天必须要定时定点巡查库房，做好“两看、四检、一通风”。两看：一看测温仪的温度数;二看干温度计的度数; 四检：一检库房是否漏雨;二检鱼粉是否有虫鼠现象;三检鱼粉是否有变质现象;四 检鱼粉垛标牌中与实物是否有不符合现象。 一通风：指经常给库房通风，以散发鱼粉垛位产生的热量及其相关气体。 要保证库房内的鱼粉不受潮、不霉变、不氧化乃至自燃、不受虫、鼠害及有害物质的污染等。

　　(3)鱼粉的运输
　　①运输工具的要求：包装物应采用符合相关卫生指标的防潮纸袋或塑料编织袋或麻袋 包装，内标塑料薄膜袋，包装封口牢固，并保证无鱼粉漏出。 a.保证运输工具洁净，防止受农药、化学药品、煤炭、油类、石灰等有毒物质的污染。b.运输工具必须得防日晒、防雨淋、防吸潮，对于发放火车皮的鱼粉，鱼粉与车皮的 墙壁之间必须有防水物隔开，以防吸潮;汽车工具必须得有苫布等防水、防晒物
　　②在装卸过程中的要求：a.应轻装轻卸，禁用手钩; b.若是托盘堆码的鱼粉，工人必须用两手抱起鱼粉包两端，且轻拿轻放，以防止鱼粉袋皮被托盘上露出的钉子刮破; c.根据车型(汽车、火车皮、集装箱)的长宽高进行合理的堆码布局。